Если, я буду пересекать границу РФ, с русским загран. Паспортом. А, в следующем пункте пересечения в Эстонии планирую показать Украин.

Граждане РФ могут безпрепятственно возвращаться в РФ. Но вам нужно будет показать украинский паспорт для выезда из РФ и быть готовым к особому вниманию и допросу.