У меня такой вопрос: лечу Баку-Стамбул и Стамбул-Подгорица компанией Пегасус. Нужно мне забирать багаж в Стамбуле или он напрямую долетит до Подгорицы?

Если у вас оба перелета в одном билете, то нет, забирать не нужно - в Баку вас зарегистрируют сразу на оба рейса и выходить из транзитной зоны в Стамбуле будет не нужно. Если билет отдельный на каждый рейс, то лучше уточнить этот момент при регистрации на рейс или у авиакомпании.