Если я привязываю карту физ. лица к карточке налогоплательщика, я просто должен указать номер счёта или нужно ещё в банк идти и как-то это подтверждать?

Привязывают не карту, а счёт Если хотите привязать счёт к id ип, надо сходить в банк и сказать об этом (не факт, что в любом банке поймут, что делать) Вообще счёт в налоговой привязывать не обязательно, если вы не плательщик НДС.

Вы имеете ввиду привящку в лк налоговой? Или саму привязку Вашего ID к счету? Простой счет физлица в лк налоговой не привяжется без привязки к нему Вашего ID, а это уже - в банк.