Подскажите, пожалуйста, - те, кто подаются изнутри и должны ждать легализации до 2 лет, точно не могут выезжать в страны Евросоюза? Как это контролируется? Спасибо.

Точно. Контролируется выборочными проверками.

Для нахождения на территории Евросоюза вам нужны легальные основания. Манифест интереса легализует вас только на территории Португалии. Выезжая с ним в ЕС, рискуете попасть на депортацию. Поговаривают о случаях, когда люди дали манифест сотруднику на границе с Испанией, и их впустили, но я думаю, что либо пограничник неумный попался, либо бессовестно врут: таких опций в законодательстве нет. Грустно, обидно, досадно, но на сегодня так.

Если у вас есть действующая шенгенская виза и ещё не кончились дни, можете кататься по странам шенгена, без проблем.