Если выехал из России на территорию Турции по русским докам, а из Турции в Болгарию - по украинским, будет ли штраф со стороны Турции за нахождение в стране более 90 дней, тк русский гражданин страну не покидал?

Вообще, международная практика гласит, что вы должны выехать из страны по тому же паспорту, по которому въезжали. Если потом как-то решите снова заезжать в турцию по паспорту РФ, проблемы возникнут. Вы же можете выехать из Турции по паспорту РФ, а уже на границе с Бг показать украинский паспорт.

Вас из Турции не выпустят просто по украинскому, потому что вы не въезжали по нему. Да и с другой стороны, вы в Турцию можете по украинскому въехать, выехав из РФ по российскому, многие так делают.