Подскажите пожалуйста есть ли смысл лететь из Казахстана, Алматы в Чолпон Ата компанией FlyArystan или проще на такси или автобусом? как эта авиакомпания? летал кто?

Летал несколько раз. Ничего страшного не заметил.

Зависит от вашего желания, времени и кошелька. Прилетите не в сам Чолпон-ата, а рядом в Тамчы. Минут 20-30 на такси. На автобусе дольше, конечно, но удобно. Выезжаете вечером, приезжаете утром. Зато намного дешевле.