По прилету в РФ симка КЗ теле 2 должна просто быть включена в роуминге?

непонятно. Во-первых роуминг надо бы подключать ещё в РК у Вашего казахстанского оператора. И поэтому причём здесь Мегафон-то, его в РК нет. Если Вы имеете в виду, что по прилёту при попытке подключить роуминг в РФ выбрали Мегафон, то Вам нужно было, в теории, 24 часа карантина подождать, а в реале может и больше. Сейчас, подождав сутки, попробуйте перезагрузиться.