У меня обратно из Токио пересадка в Шанхае где-то на 23 часа, я беру отель в аэропорту, тк вылет на следующий день рано утром.

В сумку или рюкзак кинуть проще. Можно попросить при регистрации, чтобы багаж был до Китая.

По документам транзит в любом случае будет, тк чтобы выйти без в и зы, вам надо получить наклейку Visa free transit. А её вам дадут ток когда вы покажите следующие билеты)

По багажу: если у вас china eastern, то при длительных пересадках в Шанхае они выдают багаж

Если другая а/к, то при сдаче просить в Японии регить багаж до Шанхая