Кто летит China Eastern через Шанхай транзитом в Манилу, при стыковке 12 часов, багаж не выдают в Шанхае? До конечной точки летит?

вы узнаете уже на стойке регистрации при посадке на первый рейс, ориентировочная информация может быть на билетах при покупке

универсальных правил по этому нет, в каком-то случае нужна перерегистрация, кому-то не нужна

Мы летели из Джорджтауна в Харбин через Гуанчжоу. Билеты на оба рейса выдали сразу в Джорджтауне. По багажу спросили - нужен он нам в Гуанчжоу или сразу в Харбин отправлять. То есть, возможны обе опции. Вы сами на стойке регистрации скажите, как вам нужно. Но обычно, если единая компания - то возможны оба варианта.