Подскажите, пожалуйста, где купить билеты из Токио в Киото, заранее? Я в целом нашла сайт, но не понимаю откуда будет отравляться поезд, написано просто - Tokyo station

Будет как написано - от Токио Стейшен.

smart-ex

Токио Стейшн, там вокзал Токио. Вы едете на поезде до Токио Стейшн (станция) и там выйдете на вокзал. Будут стрелочки и указатели. И там же увидите стрелочки куда идти на синкансены. Там будут ваши поезда

Билеты можете купить на станции/на др.станциях в офисах JR (погуглить на карте где они есть), если оффлайн