Если зарегистрировать брак с гражданином Аргентины (по рождению) на территории другой страны, через сколько можно подавать на гражданство, если в Аргентине пара не живет?

Ни через сколько.

Один из документов, которые Вы прикладываете к заявлению - certificado de domicilio - подтверждение адреса проживания в Аргентине.

По этому адресу еще и суд назначается.