Если гражданин с РФ гражданством пребывает на территории Казахстана свыше 120 дней накопительным итогом за год закрывают въезд? Как избежать ограничения?

Ограничения в 120 дней не избежать, потому что его не существует. Как минимум 180 дней в году гражданин РФ может быть в Казахстане при соблюдении правила 90-180

Ну не это основное, хоть там и опечатка и на самом деле 180, а не 120. В РК вас не запустят, если на момент въезда будет более 90 дней за последние 180 дней. Поэтому важно учитывать правило 90 из 180, а не суммарное количество дней за год.