Я правильно понимаю, что суйку одну на двоих взять нельзя? Если нам нужно только на два дня (один день в Токио, один в Осака) по три-четыре поездки на метро, нужно ли её покупать или можно обойтись автоматами с билетами (они же есть в метро?)

Одну нельзя. Если поездок много, посмотрите билет на 1 день.

Проездной на метро можно взять прям в метро за нал. Я в Токио брал 24-часовой за 600 йен в автомате (только Tokyo metro, не покрывает toei subway и тем более наземный транспорт) - этой сетки достаточно. В Осаке проездной 800 йен вроде (там только один оператор метро). Можно каждую поездку оплачивать. Ради двух дней париться с суйкой точно нет смысла.