Подскажите, пожалуйста, ВЫпускают ли граждан РФ через границу Польша, Литва, Латвия в Беларусь или РФ?

Напрямую -- да, не могут не выпустить. Даже если у вас были административные нарушения по пребыванию, вас выпустят, а последствия скажутся на визе и т. п. Но если вы о транзите -- типа выпустите меня из Беларуси в РФ, я хочу через Литву проехать -- то нет, это уже транзит, а не "выпуск".