Получили св-во о рождении на ребёнка в консульстве, сделали в цоне ИИН, но он не находится на сайте егов, пишет что нет данных из ЗАГСа, невозможно ничего сделать (очередь в сад, выплаты, поликлиника...) как его добавить?

Только лично обращаться в интересующий орган, например поликлинику. Они вручную будут вносить в свою систему.

Можно попробовать на егов добавить данные (сведения о рождении, оцифровать). Сработает, если свидетельство о рожд местное, не рф.