Если просрочить срок пребывания в Казахстане на 3-5 дней, что будет? Предупреждение, штраф?

До 3х предупреждение, 3-10 штраф. Но предупреждение это не пальчиком погразить, а будет зафиксировано нарушение миграционного законодательства.