Подскажите пожалуйста, можно ли оформить внж Чехии и устроиться на работу в Чехию гражданину РФ, если будет приглашение от организации чешской?

Только если вы уже находитесь легально в Чехии. Либо есть ВНЖ какой нибудь третьей страны, можете оформиться там. Посольство Чехии в рф выдает только определенные визы и визы по воссоединению с семьей.