Скажите, проход границы в Нарве с 19го сентября с ВНЖ европейским - не эстонским - нормально работает?

Нет, после 19.09 не допускается. Вот пояснение, как раз про это с официального сайта: ВОЗМОЖЕН ЛИ ТРАНЗИТ, ЕСЛИ ГРАЖДАНИН РОССИИ, ИМЕЮЩИЙ ВЫДАННУЮ ЭСТОНИЕЙ ШЕНГЕНСКУЮ ВИЗУ, ЖЕЛАЕТ ЧЕРЕЗ ЭСТОНИЮ ПРОЕХАТЬ В ДРУГУЮ СТРАНУ? До 18.09.2022: Транзит через Эстонию разрешен. С 19.09.2022: Транзит через Эстонию не разрешен. Транзит разрешен только в том случае, если гражданин России пересекает Эстонию транзитом, чтобы без остановок добраться до страны своего проживания.