есть ли у кого нибудь опыт прохода границы Эстонии если человек является работником завода который относится к военно промышленному комплексу ?

Место работы вроде проверяют при выдаче загранпаспорта, если выдали, вероятнее всего посчитали что может выезжать. Правда возможность чудес в нынешних условиях возможно.

Если вы об этом не будете всем сообщать, и не присутствуете в каком-нибудь заветном списке у пограничников, то всем все равно.

Загранпаспорт есть? Значит, можно.