Добрый день! меня интересует как покупать билеты в Японии и может есть какие-то приложения на телефон для покупки билетов?

Для того, чтобы ориентироваться, как и куда лучше доехать, можно использовать приложение, которое называет Hyperdia - его легко найдете и установите. Работает оно хорошо - называете голосом место назначения и получаете маршрут и время отправления всего транспорта по нему. Ограничения - нужна устойчивая связь.

Про обычные транспортные билеты онлайн, типа, на метро и автобусы - таких приложений не знаю.

А если вы про другие билеты - театры, концерты, спорт - то здесь, как везде - на сайтах продаются без проблем.