Кто летал в Японию, подскажите, когда я прилечу, будут ли они проверять, что я действительно что-то забронировала, не возникнет ли у них вопросов при отъезде где я жила все время?

Ну это уже вопрос не по визе, а для границы сделайте бронь с бесплатной отменой, распечатайте и возьмите, жить там необязательно. Офицер на границе может спросить, конечно, но прям допытываться никто не будет.