Подскажите пожалуйста, если делать ИНН в Казахстане, гражданину РФ, можно по внутреннему паспорту РФ или загранпаспорт нужен?

Только загран

Загран + местная сим

ИИН по внутреннему российскому паспорту сделать МОЖНО. Правда, с дополнительными телодвижениями - придется нотариально заверять написание вашего ФИО на латинице. Проблема в другом - а нужен ли вам такой ИИН? Скажем, счета и карты в банках вам не откроют, там обязателен загран (и, соответственно, ИИН, привязанный к заграну).