Гражданин России хочет приехать в Казахстан на 90 дней, насколько знаю, нужно в течении 3х дней прописаться в еконак, нужно ли после 30 дней прибывания отмечаться в миграционной, чтобы остаться ещё на 60 дней?

Не требуется, в течение 3-х на екунаке делается уведомление сразу на 90 дней.

Только посоветуйте этому гражданину РФ брать с собой загранпаспорт- ему будет легче пребывать в РК

не "прописаться в еконак" - это тут никто не поймёт, а чтобы владелец жилья, хостела, гостиницы сделал "уведомление о прибытии/проживании иностранца" - это его обязанность и ответственность. Для этого владельцу понадобится фото загранпаспорта со страницей с печатями о въезде.

про 30 дней - да, такая норма вступит в силу с 2-какого-то марта - нужно будет идти в миграционную полицию и отмечаться дополнительно.

Пока что никто не знает, как эта процедура будет проходить, и что для неё потребуется. Может быть кто-то вспомнит как она проходила раньше (довольно давно, до того как её отменили).