Надо проехать транзитом через Казахстан из Омска (легковая машина РФ) через Петропавлоск в Курган - Челябинск Будут ли проблемы по дороге?

Вы конкретизируйте вопрос про проблемы. Но я бы вам не рекомендовал, если просто транзит. Вы больше времени на двух границах потеряете. Страховка будет нужна, даже если на 3 часа в Казахстан заехали.

Ну, не должно быть проблем. Но вам казахстанская страховка понадобится. Просто обычно люди из Омска, если у них нет конкретных дел в Казахстане, не едут через Петропавловск, а едут по России в объезд Омск - Ишим - Курган. Там на 100 км длиннее дорога, но зато 2 границы не надо проходить и страховку оформлять