Подскажите пожалуйста, если хотим полететь на цветение сакуры в конце марта начало апреля, то можно пойти податься на визу в январе? там вроде можно если поездка не более чем через 3 месяца?

Да, виза действует 3 мес на въезд после выдачи, поэтому от этого срока считайте. Условно подаете в начале декабря, после выдачи виза будет действовать на въезд до начала марта, а ОТ даты въезда уже отсчет одобренных дней на въезд.

Учитывайте про даты поездки после одобрения. После одобрения у вас нет привязки к конкретной дате вылета или к конкретному промежутку

Но!

Коридор 90 дней

С момента одобрения визы у вас есть время 90 дней на пересечение границы, с момента пересечения границы идёт отсчёт разрешённых дней в Японии)

И по количеству дней визы, которые дадут

0-16 дней включительно - 15 дней дадут

17 - 31 день включителньо - дадут 30 дней

32 дня - 91 день включительно - дадут 90 дней

Как-то так