Скажите есть смысл брать экскурсию на МДН и окрестности или самостоятельно ничем не хуже?

Самостоятельно даже лучше, если есть машина - приехали когда удобно, гуляете где хотите. Это же природный объект, зачем экскурсия?

Конечно самостоятельно, вы не привязаны ни к кому, а то многие жалуются что мало времени дают на осмотр