Может кто-то подсказать, нужно ли делать регистрацию прибытия в течении 3 дней, в Астане если уже есть рвп? И что будет, если её не сделать?

нет, рвп это и есть ваша регистрация

РВП даётся на определённый срок. В течение этого срока можно выезжать и въезжать без регистрации. Предполагается, что вы зарегистрированы на этот срок по адресу, указанному в РВП.

Да нужно

Уведомление о пребывании иностранца принимающей стороной (собственником жилья) - обязанность этого собственника жилья. Штрафные санкции за отсутствие могут применяться только к собственнику, не к иностранцу. Наличие или отсутствие у вас рвп, а так же способ въезда на уведомление никак не влияет