Вопрос такой: гражданин Таджикистана пробыл в казахстане 2.5 месяца из 3 и пересекает границу к себе , и обратно когда сможет заехать?

Через 3 месяца. Но все же уточните в консульстве или миграционке.

Въехать можете сразу. Но на срок, оставшийся от 2,5 месяцев до 90 дней. Надо, конечно, в днях считать.

Сразу на оставшиеся пол месяца или через 2.5 месяца на 3 месяца.