А есть ли смысл в Японии идти к 12-ти дня в парк Юниверсал, раньше никак или там толпы будут и в зону нинтендо точно не попасть?

Зависит от погоды

Мы приезжали в дождливый день (понедельник), народу было прилично, но получилось покататься на нескольких аттракционах без особых очередей (25-30 минут, либо сингл очереди, либо обычные) - Hollywood Dream: The Ride, Harry Potter and the Forbidden Journey, Flight of the Hippogriff, Space Fantasy: The Ride. 50-55 минут ждали в очереди только на Flying Dinosaur (оно того стоило)