Хочу полететь через Стамбул и задержаться там на день. У меня есть 2 паспорта РФ и РМ, оба свеженькие. Билеты же на молдавский паспорт брать сразу?

Билеты можете брать на любой вам удобный паспорт. В турции по прилету вылету 1 и тот же паспорт, не зависимо от билета, в рф пограничникам только паспорт рф