Можно ли с индии заехать в Непал на машине с русскими номерами?

Интересно, а что может препятствовать?

И если не секрет, как в Индию попала машина с русскими номерами? Каким маршрутом ехали?

Можно, имея карнет. Тогда никаких проблем. Конкретно в Непал может и без него можно проскочить, а вот в Индию он точно нужен.