Если ни разу не был в Японии, но попробовать податься на мультивизу и на однократную одновременно, повлияет ли это, что могут не выдать однократную?

Здравствуйте, вместо мульти дадут однократную

Вы просто в анкете после количества дней поездки ставите запятую и пишите MULTIPLE + пишите мотивационное письмо.

Если мульт не дадут, то вы получите однократную визу на запрошенные дни.

А то по вашему вопросу показалось, слово вы два комплекта документов хотите собирать и нести