У меня парень без прописки и работает неофициально - это критично для отказа в визе Японии?

Прям очень негативное комбо

Я бы написал объяснительную на англ языке по отсутствию прописки (ИИ в помощь), придумайте адекватную причину

Справку с работы матери или отца (а лучше обоих, если можете) ему точно надо приложить, 100%

И свою справку из банка с остатком 400+ тысяч

И спонсорское письмо в свободной форме от родителей тоже (пример в инетрнете, ИИ тож в помощь)

ну и билеты ДО ОДОБРЕНИЯ не покупайте

лучше постараться перекрыться максимальным количеством доказательств состоятельности и благонадежности)

По спонсорству – от НЕ родственника не примут, оно допустимо только от ближайших родственников или супруга/супруги. В вашем случае, как я понял, родители парня.