Подскажите, пожалуйста, подаюсь на шенгенскую визу, не смотря на заполнение анкеты и всех данных в ЛК, нужно дополнительно заполнить файл анкеты? Или она автоматически сформируется после выбора слотов? (размечтался...)

Когда вы запишитесь,вам на почту придёт подтверждение, включая анкету. Но с очень большой вероятностью в ней будет очень много ошибок. Поэтому для подачи в ВЦ лучше скачать бланк с сайта ВЦ и заполнить анкету для подачи.