Я получила визу D Франции визитер, у меня вопрос: Если я въеду во Францию через Эстонию, это повлияет на валидацию?

Вы во Францию вылетаете в тот же день? Сохраните билет, потом его приложите при продлении

Валидация сейчас автоматизирована до такой степени, что вам достаточно просто указать дату въезда во Францию.

Контроль штампов и легальность въезда интересует при обновлении внж префектуру; а не l'ofii, но для гостевых виз такая вероятность крайне мала, билет въезда во Францию тем не менее сохраните на всякий случай, может быть когда-то в будущем, если будете на карту резидента претендовать, то ваши штампы в паспорте поизучают и не найдут въезда во Францию, то предъявить что-то придётся в качестве подтверждения.