Подскажите, в Японии на поезд Сагано в Киото нужно покупать билеты за ранее или можно приобрести на месте?

С большой долей вероятности на месте уже ничего не будет.

Если есть ино-карта, то покупайте прямо на официальном сайте Sagano Romantic Train (Гугл). Если нет, то через посредников