Подскажите. Получил итальянскую визу типа С, могу я лететь в Италию через Бутапешт ?

да, если у вас есть билет дальше в италию и обратный из италии в нешенген.

для следующего своего похода за итальянской визой сохраните какие-нибудь доказательства, что вы действительно летали в италию, а не в венгрию (посадочные талоны или счета отелей и т.д.)