Если отказали мой запрос на e-visa в Индию на год, то есть ли смысл подаваться на 5-летнюю e-visa ?

Не думаю, что есть смысл. Вам же отказали не случайно, а вполне конкретно. Зачем повторно идти в закрытую дверь? Если вам отказали не из за плохого качества документов загруженных, конечно. Есть какие то пояснения в файле с отказом? Как правило, если что-то не так, что вы можете изменить и подать снова - то об этом пишут в файле отказа.