Подскажите, пожалуйста, кто делал в консульстве заявление на выписку из квартиры в РФ? (

Вы можете пойти другим путем. Отправить из Португалии обычной почтой письмо в ФМС с заявлением о снятии с регистрационного учета подписанное Вами и с заверением подписи консульским нотариусом.

Я дублировал оба варианта. Централизованно через консульство первое заявление ушло, а второе вдогонку просто обычным письмом, как описал выше.

Оно в 99 % дойдет первым.

Плюс этого способа, что Вы можете отслеживать по треку и зафиксировать получение ими письма в отличии от полного варианта через консульство.

Ну и соответственно после получения начать их долбить и требовать в соответствии с законодательством выписки в пятидневный срок.

В моем случае сняли именно по заявлению которое отправлял собственноручно.