По итальянской визе прилетаю в Италию, затем через 9-10 дней планирую в Прагу примерно на 10-12 дней. Обязательно ли возвращаться домой через Италию?

Если потом планируете открывать длинную итальянскую визу, то вылететь лучше из Италии. В посольстве очень смотрят на то , что якобы вы всё это время находились в Италии и поднимали их "экономику". Чехия - Италия перелет копейки, поэтому советую подумать.