Лечу через Пекин транзитом в Токио, пересадка 23ч.

Странно, что в визовом центре Вам так ответили. Может, они неправильно поняли? Вам нужна виза типа G, почитайте на сайте визового центра

Безвизовый транзит даётся в аэропорту по прилёте. Куда они вас денут, когда вы прилетите туда. Выпустить в город - это на усмотрение погранцов.

Визовый центр видимо ответил про транзит 24 часа что он ставится по прилету. При прохождении контроля нужно показать билет в следующую страну и бронь отеля чтобы переночевать и увеличить шанс на выход.

Виза по прилету делается заранее через агентства. Там вроде от 2х человек.