Подскажите пожалуйста, по поводу выписки с работы, как поступить если есть трудоустройство по трудовому кодексу + самозанятость. Нужно ли указывать в анкете 2 варианта, или достаточно работу, которая по найму?

Без разницы.

Ваш доход на работе не имеет значения, зарплату .. размер, вообще можно не указывать.

Главное-это не экономнарантии ( работа), а фингарантии( ваши сбережения, финансы для обеспечения поездки)

Покажите два места работы-это не возбраняется, да и в общей картине по вашей персоне по мне будет неким плюсиком