Автобус ждёт когда пройдут все пассажиры границу эстонии-россии? 4-6 часов?

Нет. С такой задержкой на рф стороне передают пассажиров другому рейсы.

Автобусы ждут 2 часа или более половины пассажиров рейса

Смотря какой рейс. Если последний, то ждёт всех, потому что больше нет автобусов и передавать пассажиров некому.