На Янтарь на жд можно выйти на Чернышевское и дойти до Литовской границы?

Из Москвы

Можно, но с визой С гражданам РФ нужны основания для въезда в Литву.

(А гражданам не РФ и не РБ нельзя ехать участок из Москвы до Минска).