Скажите пожалуйста может ли гражданин Эстонии въехать на территорию РФ на своей машине, зарегистрированной в Эстонии?

Может, при условии что у него нет ВНЖ РФ или (гражданства РФ с постоянной регистрацией на территории ЕАЭС)

Если есть ВНЖ РФ или гражданство РФ с постоянной регистрацией в РФ или ИП РФ, то тоже может, но с залогом на таможне (дорого)