Планируем путешествие с животным. Подскажите, а сертификат 5а можно получить только в аэропорту? И можно ли ее получить без животного?

Без животного нельзя. Можно получить на границе, если вы на машине, можно в ВГНКИ.

Если из Питера, то можно получить ещё на Финляндском или Морском вокзалах.