Пытаюсь разобраться в районах Афин. Есть два варианта отелей один возле Рафина( рафины) другой-6км от центра Афин.

Рафина далековато от Афин, но ходит автобус, а пляжи есть и в районе Пирея, куда можно из центра на метро доехать, по мне лучше второй вариант, как вам, не знаю!

А 6 км от центра Афин - где? В самих Афинах тоже есть пляжи, в Палео Фалиро, на Глифаде, Вульягмени и т. д. На них можно на трамвае или автобусе доехать из центра за пол часа примерно. Понятно, что вода в мегаполисе не очень, и пляжи поприличнее обычно платные. Смотря, что в приоритете, если пляжный отдых, то лучше подальше от Афин. Если город с музеями- то в Афинах.

Рестораны, кафе, магазины удобно на гугл картах смотреть (открыть Рафину в гугл карте, все видно магазины, таверны)

Рафина - это деревня, да и по мне не сильно славится классными пляжами, на юге Афин много пляжей, да и в начале сезона даже в центре Афин есть хорошие пляжи и к центру близко за развлечением.