Можете подсказать?

В этой ситуации у гражданина КЗ просто жуть сколько теперь проблем. Мало того что уже в России он находится год, хотя гражданам КЗ можно находится в России только 3 месяца, независимо от того есть загран паспорт у него или нет. Плюс ещё удостоверение просрочено (а был бы загран паспорт не было бы с этим хотя бы проблем). В связи с этим на границе у него будут очень большие проблемы. А насчёт регистрации в России в МФЦ его не зарегистрируют, так как у него не то что удостоверение просрочено, так ещё и сроки пребывания все прошли. Тем более регистрироваться нужно было в течение месяца, когда он приехал , а не через год. В общем проблем будет теперь много.

Что значит "в посольстве не помогли"? Они обязаны выдать гражданину РК свидетельство о возвращении в РК. Но для начала нужно разобраться с властями РФ - человек находился там год незаконно или были основания?