Подскажите, пожалуйста. Визу выдала Италия, прилетаем в Венецию и через 2-3 дня полететь на Мальту и обратно через пару дней в Рим и побыть ещё в Италии. Не будет вопросов?

Не должно быть, Мальта в шенген входит насколько мне известно (но вдруг там нюансы какие) А с шенгенской визой, неважно кто выдал, вы можете передвигаться по шенгену С однократной визой перемещение должно быть прямыми перелетами\поездами\т. д. без выезда из шенгена, так как она позволяет только один въезд в шенген С двукратной то же, только 2 въезда Многократная сколько угодно въездов, главное под сроки, которые вы можете пребывать в шенгене (на визе указано)