Подскажите пожалуйста, что будет если прилечу на кипр с печатью северного, ничего страшного?

Если под "печатью северного" вы подразумеваете печать о влете/вылете через Эрджан, то при попытке въезда с севера на юг или попытке прилета через Ларнаку или пафос вы рискуете получить департацию и бан на въезд в ЕС. Это при условии, что у вас нет паспорта ес.

без паспорта ес это будет считаться нарушением пересечения границы.

В 17 или 18 году в паспорте был штамп северного Кипра (летала с турции на сев часть буквально на 3 дня) и потом благополучно много лет тут подавалась с этим паспортом на внж, не было проблем.